La práctica de la Dra. Frutos-Peterson se centra en el arbitraje, el derecho internacional y el derecho internacional de las inversiones, donde trabaja principalmente con gobiernos y entidades estatales. Ha representado a Estados extranjeros en arbitrajes inversor-Estado bajo las reglas de arbitraje del Centro Internacional de Arreglo de Diferencias Relativas a Inversiones (CIADI) y de la Comisión de las Naciones Unidas para el Derecho Mercantil Internacional (CNUDMI). También ha actuado para empresas privadas en arbitrajes comerciales internacionales
bajo el Centro de Arbitraje Internacional de Singapur (SIAC) y la Corte Internacional de Arbitraje de la CCI. La Dra. Frutos-Peterson también se ha desempeñado como árbitro bajo el Reglamento de Arbitraje de la CCI, el Reglamento de Arbitraje del ICDR y el Reglamento del Centro de Conciliación y Arbitraje (CeCAP) de Panamá. Ha sido nombrada en la Lista de Árbitros del CIADI, CeCAP, AmCham-Perú y el Centro de Conciliación y Arbitraje de Bogotá (CCB). Mientras estuvo en el CIADI, de 2001 a 2009, la Dr. Frutos-Peterson actuó como Secretaria de Tribunales en numerosos procedimientos arbitrales iniciados en virtud del Convenio del CIADI y del Mecanismo del Mecanismo Complementario del CIADI, basados en tratados bilaterales y multilaterales de inversión.